中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院的學(xué)科專業(yè)涉及理學(xué)、工學(xué)、農(nóng)學(xué)、管理學(xué)4大門類，涵蓋了15個(gè)一級(jí)學(xué)科，其中博士學(xué)位一級(jí)學(xué)科授權(quán)點(diǎn)7個(gè)、二級(jí)學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)44個(gè)；碩士學(xué)位一級(jí)學(xué)科授權(quán)點(diǎn)8個(gè)，二級(jí)學(xué)科授權(quán)點(diǎn)58個(gè)，其中包含2個(gè)專業(yè)學(xué)位授權(quán)資格；此外還有8個(gè)博士后流動(dòng)站。
    作為農(nóng)業(yè)科研單位，學(xué)院的優(yōu)勢(shì)學(xué)科主要集中在農(nóng)學(xué)門類各學(xué)科專業(yè)以及其他門類中的涉農(nóng)學(xué)科，如農(nóng)學(xué)門類中的作物遺傳育種、作物栽培、蔬菜學(xué)、茶學(xué)、土壤學(xué)、植物營(yíng)養(yǎng)學(xué)、植物病理學(xué)、農(nóng)業(yè)昆蟲與害蟲防治、動(dòng)物遺傳育種與繁殖、動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)與飼料科學(xué)、預(yù)防獸醫(yī)學(xué)等，以及理學(xué)門類中的生物化學(xué)與分子生物學(xué)、工學(xué)門類中的食品科學(xué)等專業(yè)都是我們的優(yōu)勢(shì)學(xué)科。這些學(xué)科大多依托于國(guó)家或部級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，研究實(shí)力較強(qiáng)、導(dǎo)師水平較高、獲獎(jiǎng)成果也較多。近幾年這些專業(yè)的報(bào)考人數(shù)一直比較多，屬于學(xué)院比較熱門的專業(yè)。
    此外，學(xué)院院根據(jù)農(nóng)業(yè)科技發(fā)展實(shí)際和學(xué)科建設(shè)需要，自主設(shè)置了一批特色學(xué)科，如：農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量與食物安全、作物信息科學(xué)、觀賞園藝、農(nóng)業(yè)區(qū)域發(fā)展、農(nóng)業(yè)遙感、生物安全、動(dòng)物信息科學(xué)、中獸醫(yī)學(xué)等專業(yè)，這些專業(yè)都是比較具有學(xué)院特色的學(xué)科專業(yè)。