根據(jù)企業(yè)會(huì)計(jì)制度規(guī)定，企業(yè)合并、兼并、分立一般是按資產(chǎn)的賬面價(jià)值加上應(yīng)支付的相關(guān)稅費(fèi)作為被合并、分立方入賬價(jià)值；合并、分立方的資產(chǎn)應(yīng)當(dāng)以公允價(jià)值作為入賬的依據(jù)。
    在企業(yè)所得稅上，原則上應(yīng)按公允價(jià)值轉(zhuǎn)讓、處置資產(chǎn)，計(jì)算資產(chǎn)的轉(zhuǎn)讓所得，依法繳納企業(yè)所得稅；接受資產(chǎn)方按公允價(jià)值作為計(jì)稅成本。但根據(jù)（國(guó)稅發(fā)[2000]118號(hào)）第四條（二）款規(guī)定：“如果企業(yè)整體資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓交易的接受企業(yè)支付的交換額中，除接受企業(yè)股權(quán)以外的現(xiàn)金、有價(jià)證券、其他資產(chǎn)(以下簡(jiǎn)稱“非股權(quán)支付額”)不高于所支付的股權(quán)的票面價(jià)值(或股本的賬面價(jià)值)20%的，經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)審核確認(rèn)，轉(zhuǎn)讓企業(yè)可暫不計(jì)算確認(rèn)資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得或損失。接受企業(yè)接受轉(zhuǎn)讓企業(yè)的資產(chǎn)的成本，須以其在轉(zhuǎn)讓企業(yè)原賬面凈值為基礎(chǔ)確定，不得按經(jīng)評(píng)估確認(rèn)的價(jià)值調(diào)整?！钡珡?003年1月1日起，對(duì)支付現(xiàn)金不高于所支付的股權(quán)賬面價(jià)值20%的，也可以按評(píng)估價(jià)值入賬并可在稅前扣除。因?yàn)閲?guó)家稅務(wù)總局在《關(guān)于執(zhí)行企業(yè)會(huì)計(jì)制度需要明確的有關(guān)所得稅問(wèn)題的通知》（國(guó)稅發(fā)[2003]45號(hào)）對(duì)此重新規(guī)定為：“符合《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)股權(quán)投資業(yè)務(wù)若干問(wèn)題的通知》（國(guó)稅發(fā)[2000]118號(hào)）第四條（二）款規(guī)定，轉(zhuǎn)讓企業(yè)暫不確認(rèn)資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得或損失的整體資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓改組，接受企業(yè)取得的轉(zhuǎn)讓企業(yè)的資產(chǎn)的成本，可以按評(píng)估確認(rèn)價(jià)值確定，不需要進(jìn)行納稅調(diào)整。”國(guó)家稅務(wù)總局之所以如此調(diào)整，是因?yàn)椋▏?guó)稅發(fā)[2003]45號(hào)）規(guī)定：“符合《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于股權(quán)投資業(yè)務(wù)若干所得稅問(wèn)題的通知》（國(guó)稅發(fā)[2000]118號(hào)）和《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)合并分立業(yè)務(wù)有關(guān)所得稅問(wèn)題的通知》（國(guó)稅發(fā)[2000]119號(hào)）暫不確認(rèn)資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得的企業(yè)整體資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓、整體資產(chǎn)置換、合并和分立等改組業(yè)務(wù)中，取得補(bǔ)價(jià)或非股權(quán)支付額的企業(yè)，應(yīng)將所轉(zhuǎn)讓或處置資產(chǎn)中包含的與補(bǔ)價(jià)或非股權(quán)支付額相對(duì)應(yīng)的增值，確認(rèn)為當(dāng)期應(yīng)納稅所得”。