多囊卵巢綜合征的病因尚不清楚，可能與以下三方面因素有關：
    ① 垂體促性腺激素的分泌失調。
    ② 卵巢類固醇生物合成所需酶系統(tǒng)的功能缺陷。
    ③ 腎上腺皮質功能紊亂。另外，有人觀察到，患有多囊卵巢綜合征的病人可有X型性染色體異常，如嵌合型45XX/45XO，或常染色體16 、21或22的異常。有人認為與常染色體的顯性遺傳有關，也有人認為是性染色體的顯性遺傳。