肝素鈉對動脈壁的保護作用來自許多方面，現(xiàn)綜合歸納為以下兩部分：
    1、進入體內(nèi)的肝素能選擇性地大量分布在血管壁，并在局部存留較長的時間，發(fā)揮以下的作用：①能與多種血管活性物質以及某些病毒和毒素等結合，防止它們損傷血管壁；②能避免血小板黏附、聚集和釋放損傷血管內(nèi)膜的有害物質；③能中和受損內(nèi)膜和中層組織釋放的血栓活性物質，增強內(nèi)膜表面的抗凝血酶，發(fā)揮局部抗血栓作用；④能降低血管內(nèi)膜的通透性，減少脂蛋白的透入；⑤能抑制損傷處平滑肌細胞的增殖移行。
    2、在血液中的肝素可發(fā)揮以下作用：①調整血脂代謝，增加脂蛋白酯酶活性，降低極低密度脂蛋白和低密度脂蛋白，升高高密度脂蛋白，使血液黏滯度降低，改善供氧和微循環(huán)；②糾正高凝血狀態(tài)，增加纖溶酶原激活物，促進纖溶；③抑制免疫復合物的形成和過高的補體活性；④保護動脈壁藥物的范圍很廣，抗高血壓藥、抗過敏藥、抗血小板藥和脂質代謝藥等，都有一定的保護動脈壁作用，但是都非主要作用，目前臨床上僅有肝素具有較突出的保護動脈壁效應。