風險是一種不確定性，在合同中應盡可能的把不確定性變?yōu)榇_定性。工程合同的風險主要來源于兩大方面：一是合同條款中存在陷阱，在執(zhí)行合同時，承包方或業(yè)主據(jù)此提出索賠或反索賠；二是合同本身帶來的風險，現(xiàn)在市場競爭激烈，業(yè)主經常用較苛刻的合同條款把風險轉移給承包方，或承包方為了取得工程承包權，主動提出優(yōu)惠的條件，造成風險承擔上的不平衡。
    1、采用固定價格合同帶來的風險固定價格合同，使用于工期較短、工藝較簡單的工程。雙方在專用條款中約定合同價款包含的風險范圍和風險費用的計算方式，在約定風險范圍內合同價款不再調整。這種合同形式，承包方承擔了大部分的風險。業(yè)主較喜歡采用固定總價合同，因為在執(zhí)行合同過程中，承包方索賠機會少，業(yè)主承擔的風險相對較小，而且工程結算簡單。一是價格風險，例如報價計算錯誤、漏報項目等。二是工程量風險，因做標期時間太短，投標單位無法具體計算工程量，只能憑經驗或簡單的數(shù)據(jù)估算，這是投標單位會處于兩難境地。算高了，中標的機會不大，算低了，自己要承擔很大的風險和虧損。
    2、合同條款標準不明確帶來的風險工程項目由于具有單件性、生產和技術復雜性，決定了工程合同的復雜性。合同中涉及許多標準和細節(jié)問題。例如工程質量，若在專用條款中對于“約定標準”沒有作出明確具體的解釋或缺乏可操作性，承包方很輕易造成拆除重建的返工損失，反過來說，建設方也可能會造成永久的質量問題，為以后的生產經營造成隱患。
    3、合同條款前后不一致所帶來的風險無論是工程前期的招投標、中間過程中的變更，還是工程的洽商，這些方面的書面協(xié)議和文件在合同文件中具有效力，而且簽署在后的高于簽署在前的。假如在整個工程合同的執(zhí)行過程中，簽署文件時出現(xiàn)了前后不一致的現(xiàn)象，且不利于自己一方的條款，就會帶來額外的損失。
    4、工程作業(yè)過程中設計變更帶來的風險在工程作業(yè)過程中，由于工程項目的工藝和技術的復雜性，經常涉及到工作量及其他方面的變更。這些變更必須經工程師的書面同意，否則，承包方擅自變更，即使是合理的，也要賠償損失，且延誤工期，輕易導致業(yè)主的反索賠。
    5、工程款支付約定中的風險工程價款的支付可分為四個階段：工程預付款、工程進度款、最終結算款和保留金。在合同實施過程中，工程進度款的支付是甲乙雙方矛盾存在的焦點，進度款的拖欠或提前支付都會給雙方帶來一定的風險。假如此條款不明確，對日后合同的實施，造成經濟糾紛和困難。